Kayatsuri Blog

さて、並列計算のその後ですが、いろいろとＧＡＭＥＳＳのマニュアルを読んで、並列計算の際のメモリの割あて方を調べてゆくと、ＭＷＯＲＤで規定されるreplicated dataとＭEMＤＤＩで規定されるdistributed dataを、実装メモリの量と照らし合わせて適当な値に設定すれば、私のパソコンでもかなりのレベルの計算が実行できるらしいことがわかってきました。約４００原子、２０フラグメントほどの規模のＭＰ２、６－３１Ｇ＊＊（３周期のの原子には３ｄｆ）、FMO一点エネルギー計算がＣＰＵタイム、２０時間くらいで終了します。正直、感動しました。

で、もう少し大きな規模の計算を、もう少し速く 、、、というわけで、たいした考えもなく、先日帰国した時に、梅田のヨドバシカメラで、１ＧＢのＳＤＲＡＭを二枚買ってきまして、マザーボードリミットの４ＧＢまで、ＲＡＭを増設してみました。ところで、やってしまってから気づいたことですが、３２ビット版のＸＰが扱える理論上の最大メモリ量は４ＧＢなんですね。２の３２乗ということなんでしょうけど。で、パソコンを起動して、セットアップで物理メモリ量を確認すると、確かに４ＧＢになっています。しかし、ウィンドウズ起動後にタスクマネジャで調べてみると、３．２５ＧＢまでしか認識されていません。どうもこれは、ウィンドウズの限界のようで、グラフィクスやらシステム関連のなにやらにメモリを食われて、４ＧＢ全部を使うことはできないようなのです。

さらに調べてゆくと、ウィンドウズというのは、デフォルトでは、ユーザとシステムに仮想メモリ領域を２ＧＢづつ割り付ける、つまり、普通は実装４ＧＢから３ＧＢ程度まで目減りしたメモリのうちの、たった２ＧＢしかアプリケーション用に割り当てられないというこのなのです。え～、そんなバカな。これじゃあ、詐欺みたいな話です。しかし、なんのこれしき。さらに調べてみると、これを回避する方法がないわけではなくて、ｂｏｏｔ．ｉｎｉを編集して、/３ＧＢスイッチを入れておけば、ユーザ３ＧＢ、システム１ＧＢの比で、メモリを割り付けることが出来るんだそうです。結局、私は、/３ＧＢスイッチに加えて、/ｕｓｅｒｖａ＝2900を指定して、メモリ領域の比を２．９：１．１としました。

でもねえ、なんだか変なんですよねえ。計算が走っているときに、タスクマネジャでじっくり観察していると、物理メモリ3405920KBに対して、使用可能メモリが2835000KB、これではほとんど全部あまっています。実際に使われているのは、数百ＭＢくらいでしょうか。でも、コミットチャージを見ると、しっかり7GBを越えています。それもそのはず、ページファイル（ＰＦ、仮想メモリ）が7.02ＧＢも使われているんです。まあ、そもそも、ＰＦをこれくらい大きくとらないと、ジョブが走らないのですが。なんで、こうなるんだろう？

写真は、トミーのコンサートのあった、ＪｏｕｎａｌＴｙｎｅＴｈｅａｔｅｒ の桟敷席を見上げたところ。